熒光定量PCR是分子生物學(xué)實(shí)驗(yàn)手段,也是檢驗(yàn)科常用的方法。它通過熒光染料或熒光標(biāo)記的具有特異性的探針,對PCR產(chǎn)物進(jìn)行標(biāo)記跟蹤,可以實(shí)時(shí)在線監(jiān)控反應(yīng)過程,結(jié)合相應(yīng)的軟件可以對產(chǎn)物進(jìn)行分析,計(jì)算待測樣品模板的初始濃度,也被稱為實(shí)時(shí)熒光定量pcr。
它是在PCR定性技術(shù)基礎(chǔ)上發(fā)展起來的核酸定量技術(shù)。該技術(shù)不僅實(shí)現(xiàn)了對DNA模板的定量,而且具有靈敏度高、特異性和可靠性更強(qiáng)、能實(shí)現(xiàn)多重反應(yīng)、自動化程度高、無污染性、具實(shí)時(shí)性和準(zhǔn)確性等特點(diǎn),目前已廣泛應(yīng)用于分子生物學(xué)研究和醫(yī)學(xué)研究等領(lǐng)域。在該技術(shù)中,有一個(gè)很重要的概念是Ct值。C代表Cycle, t代表threshold, Ct值的含義是:每個(gè)反應(yīng)管內(nèi)的熒光信號到達(dá)設(shè)定的域值時(shí)所經(jīng)歷的循環(huán)數(shù)。研究表明,每個(gè)模板的Ct值與該模板的起始拷貝數(shù)的對數(shù)存在線性關(guān)系,起始拷貝數(shù)越多,Ct值越小。利用已知起始拷貝數(shù)的標(biāo)準(zhǔn)品可做出標(biāo)準(zhǔn)曲線,其中橫坐標(biāo)代表起始拷貝數(shù)的對數(shù),縱坐標(biāo)代表Ct值。因此,只要獲得未知樣品的Ct值,即可從標(biāo)準(zhǔn)曲線上計(jì)算出該樣品的起始拷貝數(shù)。
熒光定量pcr常用的兩種方法分別為:熒光染料摻入法和探針法
1、熒光染料摻入法
熒光染料摻入法原理是:在PCR反應(yīng)體系中,加入過量熒光染料,熒光染料特異性地?fù)饺隓NA雙鏈后,發(fā)射熒光信號,而不摻入鏈中的染料分子不會發(fā)射任何熒光信號,從而保證熒光信號的增加與PCR產(chǎn)物的增加*同步。
2、探針法
探針法熒光定量pcr原理是:PCR擴(kuò)增時(shí)在加入一對引物的同時(shí)加入一個(gè)特異性的熒光探針,該探針為一寡核苷酸,兩端分別標(biāo)記一個(gè)報(bào)告熒光基團(tuán)和一個(gè)淬滅熒光基團(tuán)。探針完整時(shí),報(bào)告基團(tuán)發(fā)射的熒光信號被淬滅基團(tuán)吸收;PCR擴(kuò)增時(shí),Taq酶的5’-3’外切酶活性將探針酶切降解,使報(bào)告熒光基團(tuán)和淬滅熒光基團(tuán)分離,從而熒光監(jiān)測系統(tǒng)可接收到熒光信號,即每擴(kuò)增一條DNA鏈,就有一個(gè)熒光分子形成,實(shí)現(xiàn)了熒光信號的累積與PCR產(chǎn)物形成同步。